能说话、拥有自我意识的三辆交通工具型的机械生命体“炎神”。与喜欢破坏环境、制造污染公害的机械生命体蛮机族的三位大臣，在异世界 机械世界中交战。虽然炎神成功击退蛮机族，但是蛮机族的三位大臣却趁机从异世界 机械世界逃了出去。
然后半年之后，人类所居住的地球突然出现了蛮机族，在地球环境被破坏殆尽之前，三位年轻人挺身而出。他们正是赛车手江角走辅、巴士司机香板连和卖早餐少女楼山早辉，半年前追击蛮机族的而来到地球的炎神，他们赐予三人正义的力量，让三人化身为对抗蛮机族的正义英雄炎神战队轰音者。

这是一个围绕着小提琴、有关父与子的故事… 这一次的敌人是以生命能量为食而生存的吸血鬼族中的Fungaia。与之战斗的人，便是在继承自父亲的工坊中制作小提琴的红渡。尽管依靠腰带的力量，他变身为假面骑士牙，但是对于自己为何能变身，为何不得不战斗，现在还尚未可知。然而，实际上，与Fungaia战斗的并非只有渡一个人。22年前，渡的父亲——音也已经从那时开始与猖獗的Fungaia战斗。 故事一边将渡所在的现在、以及22年前——年轻的音也结婚并生下名为渡的孩子之前——紧密地联系起来，一边发展。 22年前，音也未能铲除的Fungaia不断繁衍，并出现在现代的日本。渡化身为假面骑士牙，将其打倒，并以此形态将过去与现在相连。 然而，存在的并不仅仅只是双眼所能看到的形态。在各个时代生存着的人们的命运，将会与怎样的形态相连呢？为什么Fungaia的出现，会威胁到人类的存在呢？身在其中的渡和音也所背负的命运又是…？ 各种各样的人物，生活在各种各样的时代，故事正在发展。知道这2个时代的人，只有2个…那就是将Fungaia Hunter组织化的岛，以及22年前开始经营咖啡店「Coffee Mall Damour」的木户师傅。沉浮于2个时代的人们，掌握着他们命运关键的，是这2个人，还有父亲所留下的小提琴…！？